شناسایی میکروارگانیسمها توسط پژوهشگران مرکز ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران
تعیین موقعیت فیلوژنیک بر اساس جدیدترین استاندارد بین المللی ARB و کنترل کیفیت توالی16S rRNA بر اساس ویژگیهای ساختار دوم و ساختارهای حفاظت شده
[FONT=Times New Roman (Arabic)]
به گزارش مرکز اطلاعات بیوتکنولوژی ایران، دکتر سید ابوالحسن شاهزاده فاضلی، رئیس مرکز ملی ذخایر ژنتیکی و زیستی ایران در خصوص راه اندازی این دو خدمت جدید گفت: "بنا بر اعلام كميته بينالمللي سيستماتيك پروكاريوتها، تعيين موقعيت فيلوژنتيك يكي از الزامات شناسايي پليفازيك ميكروارگانيسمها است. استفاده از سيستم[/FONT] ARB [FONT=Times New Roman (Arabic)]و پايگاههاي داده[/FONT] SILVA [FONT=Times New Roman (Arabic)]و[/FONT] LTP [FONT=Times New Roman (Arabic)]صحيحترين روش رسم درخت فيلوژنتيك بوده و توسط اين كميته به عنوان دقيقترين روش بينالمللي استاندارد معرفي شده است. اين سيستم از ويژگيهاي حفاظت شده توالي و ساختار ژنهاي ريبوزومي به منظور همراستاسازي تواليها و مشخص كردن موقعيت فيلوژنتيك سويه استفاده ميكند[/FONT]."
[FONT=Times New Roman (Arabic)]
وی افزود: استفاده از اين سيستمها براي اولين بار در خاورميانه در مركز ملي ذخاير ژنتيكي و زيستي ايران راهاندازي شده و به صورت خدمات ارائه ميشود. مجموعه نرمافزاري[/FONT] ARB [FONT=Times New Roman (Arabic)]با داشتن ابزارهاي مناسب و گروههاي دادهاي آن، امروزه در سراسر جهان به عنوان روشي استاندارد براي آناليز دادههاي[/FONT] rRNA [FONT=Times New Roman (Arabic)]در حجم انبوه پذيرفته شده است به طوري كه نخستين مقاله اين پروژه كه در سال 2004 توسط[/FONT] Ludwing [FONT=Times New Roman (Arabic)]و همكارانش منتشر شده است تا كنون بيش از 2800 بار در انتشارات معتبر علمي رفرنس داده شده است[/FONT].
[FONT=Times New Roman (Arabic)]
فاضلی در خصوص خدمت کنترل کیفیت توالی 16[/FONT]S rRNA [FONT=Times New Roman (Arabic)]بر اساس ویژگیهای ساختار دوم و ساختارهای حفاظت شده خاطر نشان کرد: "شرط اوليه صحيح بودن هر آناليز، صحت و دقت مناسب دادههاي ورودي آن است. خطاهاي ناشي از بدخوانش تواليهاي[/FONT] DNA [FONT=Times New Roman (Arabic)]در بسياري از موارد منجر به برآورد نادرست از ارتباطات فيلوژنتيك و حتي سرمايهگذاري مالي، علمي و زماني غير مفيد در شناسايي گونههاي جديد ميكربي ميشود. در اين ارتباط از آخرين ويرايشهاي نرم افزار[/FONT] ARB ([FONT=Times New Roman (Arabic)]نوامبر 2011) و پايگاههاي داده ( جولاي 2012) مطابق با آخرين استانداردهاي اعمال شده استفاده ميشود تا خطاهاي خوانشي كه بر اساس ساختار دوم و يا ويژگيهاي حفاظت شده ساختاري در محصولات ژنهاي[/FONT] rDNA [FONT=Times New Roman (Arabic)]قابل رديابي هستند، شناسايي شوند[/FONT].
[FONT=Times New Roman (Arabic)]
وی تصریح کرد راه اندازی این دو خدمت در حوزه شناسایی میکروارگانیسمها، گام دیگری در زمینه قطع وابستگی به کشورهای خارجی و کمک به پژوهشگران داخلی است[/FONT].
[FONT=Times New Roman (Arabic)]
گفتنی است این مرکز آمادگی کامل دارد تا این دو خدمت را به جامعه پژوهشی و پژوهشگران ارائه نماید[/FONT].[FONT=Times New Roman (Arabic)]
[/FONT]